Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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