Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ChmQ9QXG2 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms