Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Rnft1Q9DCN7 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnft1Q9DCN7 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms