Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PtprtQ99M80 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprtQ99M80 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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