Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Csmd1Q923L3 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms