Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Top1mtQ8R4U6 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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