Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Snx17Q8BVL3 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Snx17Q8BVL3 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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