Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Dsg1bQ7TSF1 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.6 ms