Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Q3U6N9 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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