Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Siah1bQ06985 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms