Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Taf1bP97358 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms