Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Pou5f1P20263 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms