Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
H2-Q1O19441 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms