Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms