Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm9051-201ENSMUST00000119335 1035 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Glipr1l2-202ENSMUST00000148897 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Pax4-205ENSMUST00000174194 974 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 4933432K03Rik-202ENSMUST00000206244 765 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm45834-201ENSMUST00000212445 454 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC133947.1-201ENSMUST00000213336 614 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC166358.1-201ENSMUST00000220677 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC153662.2-201ENSMUST00000221097 120 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC156037.2-201ENSMUST00000221284 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC166341.6-201ENSMUST00000221528 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 CT030242.1-201ENSMUST00000221945 125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC124772.2-201ENSMUST00000222049 154 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC153663.1-201ENSMUST00000222165 120 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC124465.1-201ENSMUST00000222349 746 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC127242.2-201ENSMUST00000223138 148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC138667.1-201ENSMUST00000225472 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC140406.3-201ENSMUST00000227619 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 I830134H01Rik-202ENSMUST00000181592 2755 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms