Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Top1mtQ8R4U6 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Top1mtQ8R4U6 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Top1mtQ8R4U6 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Top1mtQ8R4U6 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Top1mtQ8R4U6 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Top1mtQ8R4U6 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms