Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U0

Seh1l, Nucleoporin SEH1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Seh1lQ8R2U0 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Seh1lQ8R2U0 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Seh1lQ8R2U0 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms