Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Snx8Q8CFD4 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms