Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NischQ80TM9 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms