Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms