Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BC051142Q3V0M8 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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BC051142Q3V0M8 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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