Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc116-201ENSMUST00000023452 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 9330162B11Rik-201ENSMUST00000195397 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rpap3-ps2-201ENSMUST00000184741 2161 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lrrc43Q3V0L5 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Lrrc43Q3V0L5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Pabpc6-201ENSMUST00000057190 3208 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Lrrc43Q3V0L5 Dennd2d-204ENSMUST00000183271 2050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl5-202ENSMUST00000119499 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC142266.1-202ENSMUST00000227784 3733 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms