Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Usp39Q3TIX9 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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