Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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