Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC8.8□□□□□ -1
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VgfQ0VGU4 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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VgfQ0VGU4 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VgfQ0VGU4 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VgfQ0VGU4 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VgfQ0VGU4 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VgfQ0VGU4 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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