Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gjb2Q00977 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Gjb2Q00977 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms