Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Sh3bp1P55194 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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