Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
VdrP48281 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
VdrP48281 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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VdrP48281 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
VdrP48281 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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