Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Hoxd9P28357 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxd9P28357 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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