Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
DmdP11531 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms