Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Vmn2r73-201ENSMUST00000077478 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Ccl20O89093 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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