Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Sp100O35892 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms