Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vwde-202ENSMUST00000203074 5626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms