Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Usp29Q9ES63 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms