Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Trim12aQ99PQ1 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Trim12aQ99PQ1 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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Trim12aQ99PQ1 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Trim12aQ99PQ1 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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