Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ctnna3Q65CL1 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms