Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms