Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Trim71Q1PSW8 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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