Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ttc39dQ0VF76 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms