Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Grin2bQ01097 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Grin2bQ01097 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms