Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Pkp1P97350 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Pkp1P97350 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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