Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd13P70217 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd13P70217 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd13P70217 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Hoxd13P70217 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd13P70217 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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