Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PtprmP28828 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PtprmP28828 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms