Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Kif3aP28741 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Kif3aP28741 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms