Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P20040 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
P20040 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
P20040 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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