Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DmdP11531 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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DmdP11531 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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DmdP11531 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DmdP11531 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DmdP11531 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms