Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ptpn9O35239 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Ptpn9O35239 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms