Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Clrn2B2RVW2 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms