Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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