Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
OtofQ9ESF1 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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OtofQ9ESF1 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
OtofQ9ESF1 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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